Lideró al equipo en sólo nueve partidos, incluidos los primeros cuatro partidos de las eliminatorias para la Copa del Mundo del 2014, donde Eslovenia registró una victoria y tres derrotas. El partido de ida se jugó en Moscú, el cual, terminó con una victoria por 2-1 para el equipo local, con Nejc Pečnik anotando un gol crucial para Eslovenia al final del juego. España tomó una ventaja de 1-0 con un gol de Raúl, pero Eslovenia empató después de una hora de juego cuando Zahovič anotó su tercer gol del torneo. En esta ocasión, Ecuador se llevó la victoria por goleada de 6-1. Robert Arboleda abrió el marcador en el minuto 7 y apenas dos minutos después Ángel Mena amplió la ventaja para los dueños de casa. Sólo un minuto después, España volvía a tomar ventaja cuando Joseba Etxeberria anotó el gol de la victoria. España afronta uno de los veranos más intensos de los últimos tiempos. En el primer partido, Eslovenia se enfrentó a España por segunda vez consecutiva en un gran torneo, tras haber perdido el partido anterior en la Eurocopa 2000. España se adelantó en la primera parte con el gol de Raúl. En su primer partido, Eslovenia empató 1-1 con Polonia en Breslavia, antes de ganar dos partidos consecutivos en casa contra Eslovaquia e Irlanda del Norte, respectivamente.
Hoja del lunes nº 782. A Coruña. Costa Rica avanzó gracias a la regla del gol de visitante. En el partido de vuelta, celebrado en Maribor, Eslovenia derrotó a Rusia 1-0 con un gol de Zlatko Dedić, clasificando así, a su segundo mundial con un marcador global de 2-2 debido a la regla de los goles a domicilio. En el partido de vuelta, Pršo marcó el único gol del partido a los 15 minutos del segundo tiempo. El resultado final fue 1-1 y Eslovenia se clasificó para su segundo gran torneo consecutivo y su primera Copa del Mundo. Luego, Eslovenia ganó sólo un punto en los dos partidos contra la República Checa y perdió ante Irlanda del Norte, por lo que cayó al quinto lugar del grupo. Grupo D1: Lituania/Gibraltar (se determinará quién de los dos en el play-off de descenso del próximo mes de marzo), San Marino, Liechtenstein. Perdieron el tercer partido frente a Inglaterra por 0-1, y tras la victoria de Estados Unidos ante Argelia quedaron eliminados del torneo. En su segundo partido del grupo empató frente a Estados Unidos a 2 goles, a pesar de ir ganando por 2-0 al final de la primera parte, siendo Valter Birsa y Zlatan Ljubijankič los goleadores eslovenos.
Tras quedar segundo en su grupo, disputó el partido de repesca ante Rusia. Bajo su liderazgo, Eslovenia perdió en casa ante Islandia, antes de ganar cuatro partidos consecutivos para terminar tercero en el grupo, dos puntos detrás de Islandia. Dos derrotas contra Italia y otra inesperada derrota en casa, esta vez contra Estonia; dichas derrotas, significaron que Eslovenia terminó sólo en el cuarto lugar del grupo, detrás de Italia, bayer leverkusen camiseta Estonia y Serbia. En cuanto a Italia, estuvo encuadrada en el Grupo E con la selección mexicana, camiseta de boca la selección noruega y la selección irlandesa. Austria se incluyó en el Grupo G de la clasificación para la Eurocopa 2020 junto con Polonia, Macedonia del Norte, Eslovenia, Israel y Letonia. El máximo goleador de la selección durante la campaña de clasificación fue Milivoje Novaković con cinco goles. Šiljak anotó un total de nueve goles en toda la campaña, convirtiéndose así en el máximo goleador de todo el torneo de clasificación de la UEFA. En 2018, Eslovenia participó en la edición inaugural de la UEFA Nations League. Liga Europea de la UEFA. De acuerdo con el ranking FIFA, fue agrupada en la Liga C junto a Bulgaria, Chipre y Noruega. Cuatro días después, en la final en el Estádio do Dragão de Oporto, Portugal derrotó a Países Bajos 1-0, con el único gol de Gonçalo Guedes en el minuto 60 ganando la primera Liga de Naciones.
En el minuto dos, los holandeses se adelantaban en el minuto dos por un penalti anotado por Neeskens, después, en el minuto 25 de penalti, empató el conjunto alemán con un gol de Breitner, y finalmente, el alemán Müller en el 43, de esa forma Alemania consiguió su segundo campeonato mundial. Tras la derrota en Wembley, donde Harry Kane marcó el único gol del partido en el minuto 94, Katanec anunció su dimisión como entrenador. Sin embargo, Eslovenia comenzó la clasificación para la Eurocopa 2012 con una inesperada derrota en casa contra Irlanda del Norte. El equipo varios cambios de suma importancia, donde jugadores clave de la clasificación para la Eurocopa y Mundial se retiraron de la selección. La siguiente temporada, la 2017/2018, es bastante convulsa para el filial, y tras un muy mal comienzo con Carlos Pérez Salvachúa en el banquillo, este es cesado y lo sustituye Miguel Rivera, quien consigue dar la vuelta a la situación junto a los refuerzos clave en el mercado invernal y el equipo salva la categoría en la penúltima jornada frente a la Gimnástica Segoviana.
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